2015年1月，管中闵辞去“国发会主委”职务。管中闵在面对媒体时提到，他的公职生涯虽然结束，但对台湾的心愿未了，可能下学期就会回台湾大学教书，只要台大方面同意，未来也将在学校及其他层面上，继续为台湾尽一份心力。

第二，要提升行政区划管理法制化规范化水平。一是健全相关法规制度，配合国务院法制办做好《行政区划管理条例》审议出台工作，提升行政区划管理工作的法制化、规范化水平。二是完善城市型政区设置标准体系。严格按照《设立县级市标准》稳妥有序推动开展撤县设市审批；制定《市辖区设置标准》，规范设区市规模结构调整；探索建立涵盖各级、各类城市的城市型政区设置标准体系。三是推动修订地方组织法。针对目前地方组织法中缺少地级政府派出机关设置规定和县级政府派出机关设置规定不适应发展需要的问题，与有关部门一道推动修订地方组织法中关于派出机关设置的规定。

《31日24时起，汽油、柴油价格每吨上调90元和85元》马英九出任台湾地区领导人期间，管中闵曾受邀担任台“经建会主委”“国发会主委”等职务，任内多次发表“率性”言论。